25 апреля 2006 года в Москве была проведена конференция «Стратегия программы «Межрегиональные исследования в общественных науках» на новом этапе развития высшего образования в России»

В конференции приняли участие ректоры и проректоры по международным связям и науке региональных университетов, на базе которых созданы Межрегиональные институты общественных наук.

Деятельность Программы «Межрегиональные исследования в общественных науках» получила их широкую поддержку. В ходе конференции был высказан ряд идей о возможных путях дальнейшего развития Программы МИОН, в частности:

о расширении и актуализации проектов МИОНов: об организации проектов, направленных на развитие международных связей МИОНов, совместных проектов со странами СНГ – Украиной, Казахстаном, Узбекистаном;
о проведении проектов, направленных на исследование социальных последствий новых технологий, вопросов информационной, экологической и социальной безопасности, совместных проектов МИОНов и НОЦев;
о создании единого тематического журнала Программы МИОН и проведении специализированных тренингов для региональных исследователей по вопросам публикации материалов в западных периодических изданиях.